在十一月底剩下的十几天时间里，袁肃主要的工作就是针对辽东一战的善后工作，不单单是清算和抚恤阵亡将士，同时也要安排遵守“辽东十年停战期”条款，将各路部队后撤到三十里之外的地方。
他之所以没有反对“辽东十年停战期”条款，原因有二，其一所谓的“条款”都只不过是一张纸罢了，随时都能撕毁，其二就是这张纸本来就有许多漏洞可钻。他完全可以把部队撤出三十里之外，随后在最前线的几个诚实里大批量组建警察、民兵或者其他变相名义的军事力量，甚至还能培养几支“土匪”队伍潜伏在附近。
善后工作按部就班的进行着，日军的俘虏也都陆续送还到第五师团接应处。不过虽然俘虏放回去了，但是中国军队在战场上收缴的日军武器、军火甚至从俘虏和私人身上搜集的个人财物，这些可都是没有归还的。
为了纪念这次在辽东艰苦的作战，袁肃下令于盖州和营口分别建立烈士陵园和纪念碑，将所有阵亡将士的遗体统一安葬。所有被追人烈士者，其家属每个月都由原籍军队提供一笔抚恤金和一笔粮食，此事由后勤部全权监督和协助执行。有完善和持续的抚恤制度，这才能鼓舞士兵在前线英勇作战。
不仅如此，盖州烈士陵园在十一月二十九日这天完成第一期工程，迁入了四百名烈士遗体安葬。在这一天袁肃亲自来到陵园现场，一一为到场的烈士家属进行握手问候。随后他又在下葬仪式上发表演讲，一边称赞阵亡烈士英勇事迹，号令全军上下予以缅怀和纪念，另外一边也再三强调今后严格执行抚恤制度，对烈士身后事的照顾绝不能有任何含糊。
尽管整个仪式现场愁云密布、哀声遍地，伤心的气氛笼罩于全场，但是对于袁肃的一番很“实际”的讲话，却极大的赢得了到场参礼人们的信任。岂不说袁肃身为大总统侄子，又是辽东最高作战指挥官，能够亲自到场参加烈士的葬礼并与所有烈士家属握手问好，这已经表现出作为长官的一份责任和真诚。
以往打仗阵亡的士兵别说见不到长官来通知或者慰问，甚至连最基本的抚恤金都没有。
男儿参军入伍唯一能给家里带去的一笔钱是安家费，而这笔安家费几乎就算是把男儿卖给了军队，自此之后除非荣升军官，否则是死是活都不会再得到任何补偿。
可以说，正是袁肃治理军队才算是真正完善了近代中国陆军的抚恤制度，不仅条条文文写的很清楚，追认烈士的资格以及所享受的身后待遇，而且所有规定都由两套部门相互交替监督执行，确保有中饱私囊或者弄虚作假的情况。
在抚恤制度最后一页上，袁肃更是不避嫌的亲笔落书：“打牺牲者主意，必招人神共愤，非千刀万剐不足以平息吾恨。”由此可见对这套制度监管的决心。
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