水师的建制也是有着自己的风格，作为主防区之一的福建水师，主要是设于海岛的水寨，除了水寨之外，还有游兵。每个水寨大概有2000人，而游兵则是五百至一千人左右，两者构成了福建水师的基本防务。
春夏出巡，秋冬季则是在港内进行守卫，合理利用地形和气候，形成了区别以往朝代的特色。
提起本朝的对外斗争，最先想到的就是抗倭，其实这也从侧面说明了水师在明朝军队分布中的重要性。而明朝的著名将领中，因为抗倭斗争被封侯或者留名青史的大都人在。他们在抗倭斗争的中的功绩也说明了大明水师的实力，毕竟大明是一个农耕社会，面对的是当时机动性很强的沿海倭寇，在这样的情况下，还能够大胜，足以说明水师的实力。
大明水师经历朱元璋渡江战役、鄱阳湖战役、料罗湾海战等多次战役，从未战败。
但是功绩归过去，大明朝水师如此强大的实力被遗忘也是有原因的。
首先就是大明朝始终对于开拓疆土没有多大的志向，比如当时的郑和下西洋，并没有趁机继续壮大水师的实力，学习一些新的技术，而只是作为一种贸易的辅助手段，宣扬国威。初衷限制了水师的发展，其次，海防一直不是中原王朝的重点，所以明朝水师的强大也是昙花一现，福建水师总兵旗下，名义上有一万五千人，至于有多少是吃空响的，只有这些水师官兵才知道了。
米柱招安了李旦舰队，改名为黑水舰队，这是一支属于皇帝陛下的私人武装，意味着皇帝要重夺海权，加强往海洋方向的投入和发展，他这个福建巡抚自然应该追附尾骥才是。
所以米柱的行动才会得到他这巡抚大人的支持，有了巡抚的支持，他们的行为才是合理合法的，他是默许了让黑水舰队吞并福建水师的这一事实，反正这天下是皇帝的，公了私了，其实是一句话的事。
拥有了黑水舰队，他们才具备了海禁的实力，才具备了制衡这些海商，对抗西洋夷人们的实力，对于米柱的手段，李逢春非常佩服。
现在是张若定弹劾状告米柱，米柱则是拿住了张若定的一大群手下，并掌握了他儿子的犯罪证据，而李逢春则是上书弹劾张若定，本来风平浪静的福建官场突然风起云涌，斗争一下子白热化。
福建三司中，都司一向靠边站，布政使之位则是半悬空，为什么叫半悬空呢？是因为布政使林觉先早己卧病在床，己有一年多不能视事，这位林大人乃陕西陇右人，无意返回贫穷的老家，有意在此养老，所以一直不辞官，就等老死和朝廷的封赏，布政使司们的政活，都是由几个副手处理，他们诚惶诚恐，小心紧慎，就怕得罪了巡抚大人，断无挑战巡抚大人之理。
只有这张若定，在此根基深厚，朝中又有人支持，以为可以和巡抚斗上一斗，维护他们的利益，富贵险中求，张若定知道只有维护了海商和大地主们的利益，他们才会乖乖的奉上银子和势力，将你推得更高。
福建官场白热化的激斗令朝廷大为不满，官场讲的是和光同尘，一团和气，你们这些人，一开始就白刀子进，红刀子出，这是什么意思。
因为双方都是上书朝廷，这折子直至内阁，韩爌一看折子，这是老大的不爽，说道：“这个米柱，去到那里就闹到那里，不让人安生。
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