他看到孙传庭被护卫护在当中，安然无恙，心里顿时松了一口气。这时马队都已杀穿人群聚集过来，这次标营加上随身护卫孙传庭的重甲护卫，一共来了两百人，其余的留在西安防止有人趁机作乱。
本来按罗世芳的意思，一百人就足够了，他根本瞧不起这些连土匪都不如的卫所兵丁。最后为了保险起见，还是多来了一百骑，罗世芳下令聚集过来的骑兵将逃离的卫所之人驱赶过来，周围看热闹的军户早就跑的没影了，剩下的都被马队像赶羊一眼赶过来跪了下来。
孙传庭见大局已定，遂笑吟吟的看向刘辅国，开口道：“刘指挥使，听说你在官署里为本官准备了一份厚礼，咱们进去瞧瞧如何？”
刘辅国等人吐的昏天黑地，早就没了力气，个个脸上没有一点血色。听到孙传庭的话，刘辅国已然明白，自己所有一切都落入人家的算计当中，他脑中一片空白，眼神空洞，整个人瞬间苍老许多。
官署大门内走出一人，正是程千里，他身上溅满鲜血，手中软剑上犹自滴着血水。看到孙传庭后，程千里倒握软剑，向孙传庭拱手施礼道：“报大人知，里面作乱之贼已全部擒杀，后事如何，还请大人示下！”
程千里毕竟是皇帝身边之人，不能失礼，孙传庭微微拱手还了半礼，开口道：“有劳程百户，不知京师来的弟兄伤亡如何？”
程千里笑道：“多谢大人相问，弟兄们只有几个受了轻伤，我等自带伤药，敷上几天就无恙了”
孙传庭点头表示知晓，转身看向已被捆绑起来的刘辅国等人，摇了摇头，叹道：“自作孽不可活！真应了那句古话，人为财死鸟为食亡！本官对尔等也算是仁至义尽了，今日落到如此下场，尔等可谓是咎由自取！来人，全部押解回去，等候朝廷发落！”
经过查点，被标营和程千里等人斩杀的共有两百余人，受伤的三百有余，剩余的五百余人在标营的看管下清理现场，尸体装上牛车拉到荒郊野外挖坑填埋。重伤垂死的补刀一起埋掉，伤势较轻者在清理完后和那五百余人一起押解回西安，孙传庭已先行一步回了署衙，留下五十名标营官军维持卫所秩序。
回到署衙之后，孙传庭立刻给崇祯及朝廷上疏奏明此事原委，并且召集布政使等各衙门主官通报了事情的起因及结果。
朱永佑等人对孙传庭整顿卫所之事早有所知，只是都不看好他。觉得他上任时间太短，脚跟尚未站稳，就拿众所周知的顽疾动刀，有点小人得志之意，过于狂妄自大。
但因为陕西大部分高官与卫所并无牵连之故，所以众人只是冷眼旁观，等着看孙传庭的笑话。
众人万万没有想到，卫所诸人居然敢聚众闹事，这已经可以说是犯上作乱了，更没想到孙传庭如此心狠手辣，屠刀高举，杀伤如此之重。
朱永佑等人暗自心惊之下，对孙传庭的畏惧之心陡增。但对于圣上和朝廷对此事有何反应，众人想法不一，多数人心里觉得孙传庭对朝廷官员下手太过狠辣，恐怕圣上以及阁老重臣们会心中不喜。
孙传庭的奏疏快马送达京师，数日后圣旨下来了。
刘辅国、孙作旺以谋乱罪斩首，家产充公，全家发配琼州。其余从犯俱以从罪论处，家产充公，全家发往辽东效力。
孙传庭沉稳担当，勇于任事，擢升为左副都御史衔，望该员持续奋进，进一步打开局面，为早日平定陕西再立新功。
撤销西安前卫和左卫，所有人丁田亩划归相邻府县治下，此案其余有功人员由陕西巡抚酌情酬功。至此，卫所之案尘埃落定。
几日后，刘辅国、孙作旺在闹市区被明正典刑后，斩首弃市，其家眷由按察使司派人解往琼州。
杨明盛父女被送到抚衙，孙传庭亲自出面款待，对其献计送信的义举大加赞赏，杨明盛展露出来的才华也让孙传庭有了惜才之心，遂极力挽留杨明盛留在抚衙为朝廷效力。
庄元洲等人也是希望他留下，闲暇之余孙传庭可以对他们的学业进行指点，几个人只见也可以互相切磋，争取能在下一科高中，杨明盛自是痛快的答应，众人皆大欢喜。
查抄家产一事由李国良的陕西千户所经手，毕竟这是锦衣卫的长项，抚衙只是派出若干书办协助登记在册，对于查抄人员的一些小动作视若无睹，这也算一种潜规则了。
这是孙传庭特意交代过的，他也明白水至清无鱼的道理，朝廷吃肉，下面办事的人总要喝点汤才好。
锦衣卫从刘辅国家中藏银的地窖里起获了数个大小不一的银冬瓜，大的有几百斤重，小的也有数十斤，还有几十箱的银锭和几箱金砖，共计白银二十余万两。
盖因这几年持续大旱，粮食价格飞涨到二两银子一石，刘辅国十几万亩的田地所产粮食，大多转换成了银子，其家中以及在西安的粮行存粮并不多，只余几千石而已。
孙作旺与刘辅国的捞钱门路基本相同，其家中抄没的银子也有十几万两，粮食数千石，在西安的商铺若干。拿到清单的孙传庭开怀不已，仰天大笑，庄元洲、杨明盛等人也是喜动颜色。
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